基因组BUSCO评估啥意思

BUSCO评估概述

• 基因组完整性评估：BUSCO通过比较基因组与已知单拷贝直系同源基因数据库，评估基因组组装和注释的完整性。12
• 软件工具：BUSCO是一款使用Python编写的开源软件，用于评估转录组和基因组组装质量。34
• 评估原理：通过比对基因组与保守序列，鉴定组装结果是否包含这些序列，从而评价拼接结果的准确性和完整性。34
• 安装与使用：BUSCO依赖于tblastn、augustus等工具，可通过conda自动化安装，使用时需要下载相应的数据库。610
• 评估指标：BUSCO评估结果包括单拷贝基因的比对比例、完整性等，常用于评价基因组组装的完整性。78