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单细胞悬液制备的原理

3月前
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单细胞悬液的制备是单细胞转录组测序实验中的关键步骤,其原理主要包括以下几个方面:

  1. 细胞的释放:单细胞悬液制备的首要任务是将细胞从胞外基质中有效地释放出来。这可以通过机械法或酶消化法实现。机械法包括研磨法、剪碎法、匀浆法等,通过施加压力使细胞从组织中释放5。而酶消化法则是通过水解组织间的胶原纤维和黏多糖物质,分开细胞间的紧密连接,达到制备单细胞悬液的目的5

  2. 限制对细胞活性和表面修饰蛋白结构的改造:在制备单细胞悬液的过程中,需要尽量减少对细胞活性和表面修饰蛋白结构的改造,以保持细胞的原有特性。这要求在制备过程中采用对细胞损伤小、产率较高的方法6

  3. 避免细胞损伤和死亡:在制备单细胞悬液时,应避免细胞损伤或死亡。例如,台盼蓝染料的原理是细胞损伤或死亡时,台盼蓝可穿透变性的细胞膜,与细胞膜内的DNA结合,使其着色。而正常的活细胞,胞膜结构完整,能排斥台盼蓝,使之不能够进入细胞内1

  4. 细胞悬液的质量控制:单细胞悬液的质量受细胞活率、细胞浓度、结团率、背景(有核率)等因素的影响。因此,在制备过程中需要对这些因素进行控制,以确保单细胞悬液的状态和质量1

  5. 选择合适的酶类和条件:在酶消化法中,需要根据分散的组织类型确定使用的酶类,如胃蛋白酶、木瓜蛋白酶、链霉蛋白酶等,并注意使用条件和影响因素,如酶浓度、酶效价、作用时间、pH值等6

  6. 避免细胞团块或连接成片:在培养细胞单细胞悬液的制备中,需要避免两个或多个细胞粘连在一块或细胞碎片过多,因为这将影响流式细胞术(FCM)的结果,可能导致实验失败7

  7. 组织取材的前处理:对于肿瘤组织等样本,在取材后需要进行适当的前处理,如检查组织是否被冲洗干净,去除因供血不足或免疫反应形成的坏死区域,以及检查组织运输回来后的冰袋及组织冻存液的剩余含量,以减少死细胞的产生并保持细胞活性8

通过上述原理,科研人员可以制备出高质量的单细胞悬液,为后续的单细胞测序实验打下坚实的基础。

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以上内容由AI搜集生成,仅供参考

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