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请介绍 foldseek alignment 中TMscor代表什么
1周前
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深入研究一些
TM-score是衡量蛋白质三维结构相似度的指标。
Foldseek Alignment 中的 TM-score
定义
:TM-score是用于评估蛋白质结构相似度的度量,范围从0到1,值越高表示结构越相似。
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应用
:在Foldseek中,TM-score用于量化查询序列与目标序列在结构上的相似性,帮助确定蛋白质结构的对齐质量。
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计算
:TM-score的计算考虑了蛋白质结构中所有对应α-碳原子之间的距离,通常与结构对齐算法结合使用,如Foldseek。
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蛋白质结构相似度如何评估?
Foldseek Alignment的工作原理是什么?
TM-score在蛋白质结构预测中的作用是什么?
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