outcome_data <- read_outcome_data(filename = "outcome_eur_rsid_reformatted_new.csv", snps = exposure_data$SNP, snp_col = "SNP",sep = ",",beta_col = "BETA", se_col = "SE",effect_allele_col = "A1",other_allele_col = "A2", pval_col = "p",eaf_col = "FRQ",chr_col = "CHR",pos_col = "BP")这一串代码里的outcome_eur_rsid_reformatted_new.csv是怎么来的？

代码分析

• 数据来源：outcome_eur_rsid_reformatted_new.csv 是一个CSV文件，用于存储结果数据。

数据准备

• 数据读取：该文件通过 read_outcome_data 函数被读取，该函数用于准备用于MR或富集测试的数据。14579
• 数据组织：函数会检查和组织列，以确保数据格式适合进行MR分析或富集测试。15
• 参数指定：代码中指定了多个参数，如 snps, snp_col, beta_col 等，这些参数帮助函数正确地识别和使用文件中的列。479

数据推断

• p值推断：如果可能，函数会从beta值和标准误差推断p值。5

数据整理

• 数据整理：文件名中的 "reformatted" 表明数据可能经过了某种形式的整理或重新格式化，以符合分析的需要。49

总结

outcome_eur_rsid_reformatted_new.csv 文件是通过数据准备和整理过程得到的，用于存储与暴露数据相对应的结果数据，并通过 read_outcome_data 函数进行读取和分析。14579