ADUA c.1561G>A

ADUA基因的c.1561G>A变异与I型黏多糖病（Mucopolysaccharidosis type I, MPS I）有关。这种变异导致α-L-艾杜糖醛酸苷酶（IDUA）的氨基酸序列发生改变，具体为甘氨酸（Gly）521位点被丝氨酸（Ser）替代，即p.Gly521Ser。这种单核苷酸变异（single nucleotide variant）位于染色体4p16.3的位置2。

根据ClinVar数据库的记录，c.1561G>A变异的遗传方式为常染色体隐性遗传，并且该变异的临床意义被分类为“不确定意义”（Uncertain significance），最后一次评估是在2022年4月22日。该变异的评审状态为1星（最高4星），意味着提供的证据有限，仅有单一提交者提供了评审2。

此外，该变异的基因型和表型关系尚未明确，没有提供足够的证据来支持其临床影响，因此其临床意义的评审状态为0星（最高4星）。这意味着目前没有足够的信息来确定该变异是否对疾病有直接的临床影响2。

值得注意的是，除了IDUA基因，c.1561G>A变异也可能与其他基因相关，例如PANK2基因，这可能与不同的疾病表型有关47。然而，对于IDUA基因而言，c.1561G>A变异是与I型黏多糖病相关的关键变异之一。

在研究和诊断过程中，了解这种变异的临床意义和遗传模式对于早期诊断和治疗I型黏多糖病至关重要。然而，由于目前证据有限，需要更多的研究来明确c.1561G>A变异的确切作用和影响。

c.1561G>A变异在不同基因中的具体影响是什么？

c.1561G>A变异是一种单核苷酸变异，其具体影响取决于它在哪个基因中发生。例如，在IDUA基因中，这个变异导致氨基酸变化p.Gly521Ser，与Mucopolysaccharidosis type 1（MPS I）相关2。在PANK2基因中，同样的变异引起p.Gly521Arg的氨基酸替代，与Hypoprebetalipoproteinemia, acanthocytosis, retinitis pigmentosa, and pallidal degeneration相关7。此外，该变异在FXII基因中引起p.V521M的氨基酸替代，被认为是一种罕见变异，并且与心脏疾病有关58。在PTCH1基因中，c.1561G>A变异导致p.Ala521Thr的氨基酸变化9。

这种变异在Mucopolysaccharidosis type 1中的具体作用是什么？

Mucopolysaccharidosis type 1（MPS I）是一种由IDUA基因突变引起的溶酶体贮积症。c.1561G>A变异在IDUA基因中引起p.Gly521Ser的氨基酸替代，这可能影响α-L-iduronidase酶的活性，从而导致MPS I的病理过程2。MPS I的特征是多系统受累，包括骨骼异常、面部特征改变、心脏瓣膜疾病、呼吸道问题和智力障碍1920。该病通常由父母传递的两个异常基因拷贝引起，是一种常染色体隐性遗传病2123。

为什么c.1561G>A的Germline分类是不确定的，而Somatic分类没有临床影响？

c.1561G>A变异的Germline分类被标记为“Uncertain significance”，这意味着目前没有足够的证据来确定这个变异是否会导致疾病，或者其影响程度如何2。它最后一次评估是在2022年4月22日，并且只有一个提交者提供了标准，因此其评价状态是1星（最多4星），表明证据不足。相比之下，Somatic分类没有标记为具有临床影响，这意味着这个变异在体细胞中不被认为是导致癌症或其他体细胞疾病的直接原因。Somatic分类的评价状态是0星，表明没有提供任何断言标准2。

c.1561G>A变异在不同数据库中的记录状态和评价标准是什么？

c.1561G>A变异在ClinVar数据库中的记录状态是“current”，并且具有RCV003112112.3的Accession编号2。在LOVD数据库中，该变异与PANK2基因相关，并且有一个个体ID: 00410367，表明它被认为是影响功能的4。在CardioDB数据库中，c.1561G>A变异被记录为p.V521M的替代，并且被认为是罕见的，与心脏疾病有关5。这些不同的数据库提供了关于c.1561G>A变异的不同信息和评价，反映了其在不同基因和疾病中的多样性。

c.1561G>A变异在不同基因中的HGVS命名规则有何不同？

HGVS（人类基因组变异协会）命名规则为不同的基因变异提供了一种标准化的命名方法。对于c.1561G>A变异，其HGVS命名可能会根据所涉及的基因和转录本的不同而有所变化。例如，在IDUA基因中，该变异的HGVS命名包括多个选项，如NM_000203.5:c.1561G>A，这是根据mRNA的命名2。在PANK2基因中，同样的变异有不同的命名，如NM_153638.2:c.1561G>A4。此外，HGVS还允许根据基因组坐标进行命名，如NC_000004.12:g.1003381G>A，这反映了变异在基因组中的具体位置2。不同的HGVS命名允许研究人员根据上下文准确地识别和交流特定的变异。464748