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已经按照outlier_indices = run_mr_presso(dat, NbDistribution = 5000)这个代码跑出了离群值,什么代码可以剔除离群值

3ebafb5e2
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理解问题已经按照outlier_indices = run_mr_presso(dat, NbDistribution = 5000)这个代码跑出了离群值,什么代码可以剔除离群值

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剔除离群值的代码

  • 使用outlier_indices结果:在运行MR-PRESSO后,可以通过outlier_indices变量识别出离群值的索引14
  • 剔除操作:使用这些索引来从原始数据集中剔除对应的离群值1

具体的代码实现可以是:

# 假设dat是你的原始数据集,包含了SNP和相应的beta值
# outlier_indices是从run_mr_presso返回的离群值索引
dat_clean <- dat[-outlier_indices, ]

这段代码将使用逻辑索引来排除那些被识别为离群值的行,从而得到一个剔除了离群值的清洁数据集dat_clean14

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