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out <- directionality_test(dat_end) 是什么代码

3ebafb5e2
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理解问题out <- directionality_test(dat_end) 是什么代码

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out <- directionality_test(dat_end) 是一行R语言代码,用于执行Steiger方向性检验。3

Steiger方向性检验

  • 功能: 判断暴露与结局之间的因果方向是否正确。5
  • 输入: dat_end,即经过数据协调(harmonization)后的暴露和结局数据。3
  • 输出: 返回一个列表,包含方向性检验的结果。3

详细说明

  • 方向性检验: 用于验证假设“暴露导致结局”是否有效。5
  • 应用场景: 在孟德尔随机化研究中,确保因果关系的方向正确性。3
  • 结果解读: 如果方向性检验的P值很小,表明方向正确;否则可能需要重新考虑因果假设。3

示例代码

bmi_exp_dat <- extract_instruments(outcomes = 'ieu-a-2')
chd_out_dat <- extract_outcome_data(snps = bmi_exp_dat$SNP, outcomes = 'ieu-a-7')
dat <- harmonise_data(bmi_exp_dat, chd_out_dat)
out <- directionality_test(dat)
out
  • 数据提取: 从数据库中提取BMI作为暴露变量,冠心病作为结局变量的数据。1
  • 数据协调: 协调暴露和结局数据,确保数据格式一致。1
  • 方向性检验: 执行Steiger方向性检验,验证因果方向。3

结果示例

$snp_r2.exposure
[1] 0.012345

$snp_r2.outcome
[1] 0.001234

$correct_causal_direction
[1] TRUE

$steiger_pval
[1] 0.000123
  • 解释: 暴露变量的r方(snp_r2.exposure)大于结局变量的r方(snp_r2.outcome),且方向性检验的P值很小(steiger_pval),表明因果方向正确。3
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孟德尔随机化研究的基本步骤?
如何选择合适的暴露和结局变量?
孟德尔随机化在医学研究中的应用?

以上内容由AI搜集生成,仅供参考

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