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out <- directionality_test(dat_end) 是什么代码
1个月前
理解问题out <- directionality_test(dat_end) 是什么代码
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out <- directionality_test(dat_end)
是一行R语言代码,用于执行Steiger方向性检验。3
Steiger方向性检验
详细说明
- 方向性检验: 用于验证假设“暴露导致结局”是否有效。5
- 应用场景: 在孟德尔随机化研究中,确保因果关系的方向正确性。3
- 结果解读: 如果方向性检验的P值很小,表明方向正确;否则可能需要重新考虑因果假设。3
示例代码
bmi_exp_dat <- extract_instruments(outcomes = 'ieu-a-2')
chd_out_dat <- extract_outcome_data(snps = bmi_exp_dat$SNP, outcomes = 'ieu-a-7')
dat <- harmonise_data(bmi_exp_dat, chd_out_dat)
out <- directionality_test(dat)
out
结果示例
$snp_r2.exposure
[1] 0.012345
$snp_r2.outcome
[1] 0.001234
$correct_causal_direction
[1] TRUE
$steiger_pval
[1] 0.000123
- 解释: 暴露变量的r方(
snp_r2.exposure
)大于结局变量的r方(snp_r2.outcome
),且方向性检验的P值很小(steiger_pval
),表明因果方向正确。3
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out <- directionality_test(dat_end) 是什么代码不在提醒