NCBI Nucleotide Database 是一个核酸序列数据库,为生物医学研究和发现提供基础数据。
数据库概述
- 核酸序列基础:数据库包含基因组、基因和转录本序列数据,是生物医学研究的基础。19
数据检索方式
- Entrez Nucleotide 搜索:使用 Entrez Nucleotide 可以搜索序列标识符和注释。2
- BLAST 程序:标准核苷酸 BLAST 程序,如 BLASTN,用于搜索核苷酸数据库,寻找序列间的局部相似性。35
国际合作与政策
- INSDC 合作:国际核苷酸序列数据库合作组织(INSDC)是收集和提供核苷酸序列数据的核心基础设施。6
- 数据收集与发布政策:该合作组织有明确的收集和发布核苷酸序列和注释的目标和政策。4
数据库功能与接口
- 多类型序列组织:Nucleotide 收集并组织来自 NCBI 及其他来源的多种类型的核苷酸序列。7
- 搜索接口:提供界面进行序列搜索,包括构建多组分搜索的示例。8