sap18
SAP18,全称为Sin3A associated protein 18,是一种在进化上保守的蛋白质,最初是在与转录调控蛋白Sin3的复合体中被发现的12。SAP18在细胞中扮演着重要的角色,它是组蛋白去乙酰化酶复合体的一个组成部分,这个复合体还包括SIN3、SAP30、HDAC1、HDAC2、RbAp46、RbAp48以及其他多肽67。SAP18直接与SIN3相互作用,并增强了该复合体的活性,从而在调控真核生物基因表达中发挥关键作用。
SAP18的三维结构显示,它具有一个类似泛素的折叠结构,并与其他家族成员相比有几个大的环插入4。此外,SAP18还被发现在剪接调控中具有新功能,研究表明HIV-1整合酶和INI1/hSNF5能够结合SAP18,并招募Sin3a-HDAC1复合体的组分3。在植物中,SAP18的功能丧失突变体对NaCl更敏感,并且在叶绿素合成方面与野生型相比受损5。
SAP18的基因ID为10284,最近一次更新是在2024年6月9日。它是一个编码蛋白质的基因,其RefSeq状态为REVIEWED,属于人类(Homo sapiens)的基因组3。SAP18的官方符号由HGNC提供,其官方全名为Sin3A associated protein 18。此外,SAP18还被称为SAP18P和2HOR02023。
总结来说,SAP18是一个在多种生物中保守的蛋白质,作为组蛋白去乙酰化酶复合体的一部分,在调控基因表达中起着重要作用。同时,SAP18在剪接调控和植物对环境压力的响应中也发挥作用。34567。
SAP18与其他组蛋白去乙酰化酶复合体成员的相互作用机制是怎样的?
SIN3-HDAC复合体在组蛋白去乙酰化过程中起着重要作用,它通过促进局部组蛋白去乙酰化来调节染色质的可及性和基因表达。然而,根据您提供的参考资料,并没有直接提及SIN3-HDAC复合体中SAP18与其他组蛋白去乙酰化酶复合体成员的相互作用机制。不过,我们可以从参考资料中获取一些相关信息。
首先,组蛋白去乙酰化酶(HDACs)是一类进化上保守的酶,它们可以去除组蛋白上的乙酰化修饰,并在表观遗传基因沉默中发挥核心作用11。组蛋白的去乙酰化通常与染色质的紧密打包和基因沉默相关,而乙酰化则有利于染色质的松弛和基因的激活10。
在SIN3-HDAC复合体中,SIN3是一个支架蛋白,它能够招募HDAC和其他相关蛋白,形成复合体。这种复合体的形成有助于在特定的染色质区域进行组蛋白去乙酰化,从而调控基因表达14。尽管没有直接提及SAP18,但我们可以推测SAP18可能通过与SIN3或其他HDAC复合体成员相互作用,参与调控染色质结构和基因表达。
此外,组蛋白去乙酰化酶复合体的成员可能通过直接相互作用或通过共同参与某些生物学过程来协同工作。例如,中科院植物所林荣呈研究组通过IP-MS技术鉴定到一个去乙酰化酶复合体(SNL-HDA19),其成员包括HDA19、SNL1~6和MSI1,它们都是光信号通路的负调节因子12。这表明组蛋白去乙酰化酶复合体成员之间可能存在复杂的相互作用网络。
综上所述,尽管没有直接的证据描述SAP18与其他组蛋白去乙酰化酶复合体成员的相互作用机制,但我们可以推测这种相互作用可能涉及直接的蛋白质-蛋白质相互作用,以及通过共同参与染色质重塑和基因表达调控过程的协同作用。然而,为了获得更深入的理解,需要进一步的实验研究和文献支持。
SAP18在HIV-1整合酶和INI1/hSNF5结合过程中扮演什么角色?
SAP18在HIV-1整合酶和INI1/hSNF5结合过程中的角色并没有在提供的参考资料中明确提及。然而,根据资料18和21,我们可以推测一些可能的联系和作用。
首先,INI1/hSNF5在HIV-1病毒在宿主细胞内的传播中起着调节作用,特别是对HIV-1整合的几个基本步骤具有重要影响18。这表明INI1/hSNF5可能在整合酶的作用过程中扮演着某种角色。此外,使用小的干扰RNA的研究表明,含Ini1/hSNF5的SWI/SNF复合物参与了整合的HIV-1长末端重复序列的基础活性的转录抑制21。这进一步强调了INI1/hSNF5在HIV-1整合过程中的重要性。
尽管SAP18在这些过程中的具体作用没有直接的描述,但考虑到SAP18通常与转录调控和染色质重塑有关,我们可以合理推测SAP18可能通过与INI1/hSNF5相互作用或影响其功能,间接地参与HIV-1整合酶的活性调节或整合过程。这种作用可能涉及到染色质结构的改变,为整合酶提供更易于接近的宿主DNA靶点,或者通过影响转录活性来调节整合酶的表达或功能21。
然而,需要更多的研究和实验数据来明确SAP18在HIV-1整合酶和INI1/hSNF5结合过程中的具体角色和机制。当前的资料并没有提供足够的信息来详细阐述这一点。1821
SAP18的基因ID更新和RefSeq状态对研究其功能有何影响?
SAP18的基因ID更新和RefSeq状态对于研究其功能具有重要影响,主要体现在以下几个方面:
-
确保研究的准确性:基因ID的更新有助于确保研究者正在研究的是正确的基因。根据24,Gene ID通常被分配给RefSeq数据库中注释为基因的对象。如果基因ID发生了变化,这可能意味着基因的注释或定义有所更新,这对于理解基因的功能至关重要。
-
获取最新的基因信息:RefSeq记录的状态更新,如从“预测的”或“临时的”状态更新为“检查过的”状态27,表明了关于该基因和其转录子的知识已经得到了进一步的验证和完善。这为研究者提供了更准确和可靠的基因序列信息,有助于深入研究SAP18的功能。
-
利用高质量的参考序列:RefSeq项目生成的参考序列是稳定的、非冗余的26。这意味着,当SAP18的RefSeq状态更新,研究者可以依赖这些高质量的序列作为研究的基础,从而提高研究的质量和可靠性。
-
促进数据的标准化和比较:使用更新的RefSeq记录,研究者可以更容易地将他们的发现与其他研究进行比较。因为RefSeq提供了一组标准化的参考序列,这有助于跨研究的数据整合和分析2627。
-
影响基因功能的推断:根据31,如果一个基因在非正常条件下(如时间、位置、物种)表达时仍然保持其功能,我们可以推断该基因具有特定的功能。RefSeq状态的更新可能提供了关于SAP18在不同条件下表达模式的新信息,这对于理解其功能至关重要。
-
临床研究的相关性:正如32所展示的,基因表达水平的变化与疾病状态(如肝癌)有关。如果SAP18的基因ID或RefSeq状态更新,这可能影响对其在疾病中作用的理解,进而可能影响临床诊断和治疗策略。
综上所述,SAP18的基因ID更新和RefSeq状态对于确保研究的准确性、获取最新信息、利用高质量参考序列、促进数据标准化、推断基因功能以及理解其在临床研究中的重要性都具有显著影响。2426273132
SAP18在细胞核中的作用是什么?
SAP18是一种组蛋白乙酰化相关蛋白,它在真核基因表达调控中起着关键作用。组蛋白乙酰化和去乙酰化是细胞核内重要的调控机制,它们通过改变染色质的结构来影响基因的表达。"SAP18的详细信息,包括基因名称,代码,染色体位置,相互作用关系和通路,简述为组蛋白乙酰化起着在真核基因表达的调控中起关键作用。"33。在细胞核中,SAP18可能通过参与染色质重塑和转录调控等过程,影响基因的表达和细胞功能。
此外,细胞核是细胞的控制中心,它在细胞的代谢、生长、分化中起着重要作用。"细胞核是细胞的控制中心,在细胞的代谢、生长、分化中起着重要作用,无核的细胞不能长期生存,这是由细胞的功能决定的。"34。SAP18作为细胞核内的一个重要组分,可能通过其在基因表达调控中的作用,间接影响细胞核的这些基本功能。
综上所述,SAP18在细胞核中的作用主要体现在参与组蛋白乙酰化,调控基因表达,进而影响细胞核的基本功能和细胞的生理活动。然而,目前关于SAP18在细胞核中的具体作用机制和影响范围还需要进一步的研究来阐明。
SAP18在植物对NaCl敏感性增加和叶绿素合成受损中的具体作用机制是什么?
SAP18是一种植物中的重要蛋白质,它在植物对NaCl(氯化钠)敏感性增加和叶绿素合成受损中的作用机制可能涉及多个方面。根据提供的参考资料,我们可以从以下几个方面来探讨SAP18可能的作用机制:
-
光合作用和叶绿素合成:SAP18可能通过影响植物的光合作用和叶绿素合成来应对NaCl胁迫。在盐环境下,施氮(N)可以促进甜菜叶片叶绿素的合成,提高类囊体膜的垛叠程度,从而减少PSII的损伤,维持较高的光能吸收、传递和转换效率42。这表明SAP18可能通过调节光合作用相关过程来提高植物对NaCl的耐受性。
-
离子平衡和膜透性:SAP18可能参与植物体内离子平衡的调节,以应对盐碱胁迫。植物通过合成渗透调节物质、调节离子通道和转运蛋白等机制来维持离子平衡和膜透性,从而提高对盐碱的耐受性43。SAP18可能通过影响这些过程来减少NaCl对植物的负面影响。
-
根系吸收范围:SAP18可能通过扩大植物根系的吸收范围来提高植物的耐盐性。在分析盐胁迫对植物影响的基础上,有研究总结了AMF(丛枝菌根真菌)通过重建植物体内离子平衡和扩大根系吸收范围来提高植物耐盐性的相关机制44。SAP18可能通过类似机制,增强植物根系对水分和营养的吸收,以减轻盐胁迫。
-
适应机制:SAP18可能是一种适应机制,有助于植物在多细胞生物进化过程中形成对环境变化的适应性。这种适应机制有助于降低植物体内生命活动对外界环境的依赖性,提高对环境因素的耐受能力46。在NaCl胁迫下,SAP18可能通过调节植物的生理和生化过程,增强其对盐分的适应性。
-
植被恢复和改造:SAP18可能在盐碱地植被恢复和改造中发挥重要作用。通过对不同植物进行NaCl、Na2SO4胁迫处理的研究,可以筛选出对盐碱地具有较高耐受性的植物资源,为植被恢复和改造提供科学依据45。SAP18可能在这些植物中起到关键作用,通过其在植物生理和分子层面的调节功能,提高植物对盐碱环境的适应性。
综上所述,SAP18在植物对NaCl敏感性增加和叶绿素合成受损中的具体作用机制可能涉及光合作用调节、离子平衡和膜透性调节、根系吸收范围扩大、适应机制形成以及植被恢复和改造等多个方面。然而,具体的分子机制和生理过程仍需进一步的研究来阐明。
Sin3 associated protein 18 (SAP18)1 | SAP18的发现 SAP18是与转录调控蛋白Sin3复合体中发现的进化保守蛋白。 |
A novel function of SAP18 in splicing regulation3 | SAP18在剪接调控中的新功能 研究表明HIV-1整合酶与SIN3a-HDAC1复合体通过SAP18相互作用。 |
The solution structure of SAP184 | SAP18的溶液结构 SAP18具有与家族成员相比有几个大环插入的泛素样折叠。 |
The AtSAP18 loss-of-function mutant5 | AtSAP18功能丧失突变体 该突变体对NaCl更敏感,与野生型相比叶绿素合成受损。 |
The protein encoded by this gene is a component of the histone deacetylase complex6 | 组蛋白去乙酰化酶复合体的组成部分 SAP18编码的蛋白是包括SIN3、SAP30、HDAC1等的组蛋白去乙酰化酶复合体的组成部分。 |
SAP18 Sin3A associated protein 187 | SAP18基因信息 该基因编码的蛋白是组蛋白去乙酰化酶复合体的一部分,与SIN3直接相互作用。 |
Sin3 associated protein 18 (SAP18)1 | SAP18 Overview A conserved protein linked with Sin3 in transcriptional regulation. |
Histone deacetylase complex6 | Complex Overview Multisubunit complex including SAP18, involved in gene expression regulation. |
Sin3 associated protein 18 (SAP18)1 | SAP18 Overview A conserved protein linked with Sin3 in transcriptional regulation. |
SAP183 | SAP18 in Splicing Regulation Component in histone deacetylase complex, interacts with HIV-1 integrase. |
SAP184 | SAP18 Structure Features a ubiquitin-like fold with large loop insertions. |
AtSAP185 | AtSAP18 Mutant Sensitive to NaCl, impaired in chlorophyll synthesis. |
SAP186 | Histone Deacetylase Component Part of a complex including SIN3, SAP30, HDAC1, HDAC2. |
SAP187 | Gene Component Encodes a component of the histone deacetylase complex. |