公司注册地重庆，社保代缴为第三方代缴公司缴纳社保且在成都，员工生育津贴应该按照社保缴纳公司还是按照合同签订公司来，与产前工资差额部分应由用人单位还是代缴公司补齐。请结合四川和重庆相关法律法规进行分析，并表明法律文件出处

员工生育津贴应按照社保缴纳公司即成都的计算方式来确定。

重庆与成都生育津贴计算方式

重庆计算方式：生育津贴=单位上年度月平均工资÷30天×产假天数。1

成都计算方式：生育津贴按生育时所在用人单位上年度职工日平均工资乘以相应天数计发。3

法律文件出处

重庆：依据《关于印发重庆市生育保险实施办法的通知》。

成都：依据《关于印发成都市生育保险和职工基本医疗保险合并实施办法的通知》(成医保发〔2019〕30号)。5

差额补齐责任

与产前工资差额部分应由用人单位补齐。根据《社会保险法》规定，用人单位有责任确保员工的生育津贴不低于其产前工资水平。6

综合分析

尽管公司注册地在重庆，但由于社保由成都的第三方代缴公司缴纳，因此员工的生育津贴应按照成都的计算方式来确定。同时，用人单位需确保员工的生育津贴不低于其产前工资，如有差额，用人单位应负责补齐。